La première description scientifique du genre vient d'Étienne Geoffroy Saint-Hilaire en 1795, qui choisit la mouffette rayée comme espèce type. Les espèces du genre Mephitis représentent le groupe frère du genre Spilogale, également répandues en Amérique du Nord et en Amérique centrale, bien que les ancêtres de ces deux genres se soient séparés il y a environ 12 millions d'années. Les mouffettes du genre Conepatus, plus concentrées en Amérique du Sud, contrastent avec celles-ci. Chez Mephitis, la radiation des espèces connues aujourd'hui s'est produite il y a environ 3 à 3,5 millions d'années.
LES ESPÈCES
Selon la classification actuelle, l'ITIS reconnaît deux espèces distinctes formant le genre Mephitis :
*Mouffette à capuchon - Mephitis macrouras : l'aire de répartition s'étend du sud-ouest des États-Unis jusqu'au Costa Rica en passant par le Mexique
*Mouffette rayée - Mephitis mephitis : répandue dans le sud du Canada , dans presque tous les États-Unis et dans le nord du Mexique