Le genre Enhydra a été défini en 1822 par le zoologiste et géologue écossais John Fleming dans sa propre publication consacrée à la zoologie. L'espèce type est (désignation monotypique) la loutre de mer (Enhydra lutris).
Les loutres de mer ont probablement divergé des autres loutres au cours du Pliocène, il y a environ 5 millions d'années. Elles sont probablement issues de l'Enhydritherium, une loutre bunodonte endémique d'Amérique du Nord à la fin du Miocène et au début du Pliocène.
Enhydra reevei, la plus ancienne espèce connue, trouve ses origines dans l'Atlantique, ce qui suggère que c'est peut-être là que les loutres de mer sont originaires. Des preuves fossiles indiquent que la lignée Enhydra s'est isolée dans le Pacifique Nord il y a environ 2 millions d'années, donnant naissance à l'Enhydra macrodonta, aujourd'hui éteinte, et à la loutre de mer moderne.
LES ESPÈCES
Auparavant considéré comme monotypique, le genre Enhydra s'est vu attribuer deux autres espèces fossiles :