Le lapin sauvage d'Afrique centrale est attribué aux léporidés en tant qu'espèce indépendante et genre monotypique. Aucune sous-espèce n'est distinguée au sein de l'espèce. Elle a été décrite pour la première fois en 1929 par Jane St. Leger, et en 1932, elle a également décrit le genre Poelagus et lui a attribué l'espèce comme type.
En 2004, sur la base de données de biologie moléculaire, Conrad A. Matthee et al. ont développé un cladogramme qui montre les relations phylogénétiques des genres au sein de la famille des léporidés. En conséquence, le lapin sauvage d'Afrique centrale est comparé à un taxon composé des espèces des genres d'Asie du Sud-Est Pronolagus et Nesolagus en tant qu'espèce soeur.