Cavia est classé dans l'ordre des rongeurs, bien qu'il y ait eu autrefois une croyance minoritaire dans la communauté scientifique selon laquelle les preuves de l'ADN et des protéines mitochondriales suggéraient que les Hystricognathi pourraient appartenir à une ramification évolutive différente, et donc à un ordre différent. Si cela avait été le cas, cela aurait été un exemple d'évolution convergente. Cependant, cette incertitude présente en grande partie un intérêt historique, car de nombreuses preuves génétiques moléculaires soutiennent désormais de manière concluante la classification des Cavia comme rongeurs. Cette preuve inclut des ébauches de séquences génomiques de Cavia porcellus et de plusieurs autres rongeurs.
LES ESPÈCES
Historiquement, il y a eu peu de consensus concernant le nombre d'espèces de Cavia et leurs affiliations taxonomiques. Les caractères morphologiques différenciant les espèces de Cavia sont limités et les niveaux de variation morphologique inter et intraspécifique n'ont pas été bien documentés. Les interprétations ont donc varié et ont abouti à des conclusions taxonomiques très différentes. Trois scientifiques n'étaient pas d'accord sur le nombre d'espèces, Tate (1935) en a reconnu 11, tandis que Cabrera (1961) en a reconnu 7 et Huckinghaus (1961) n'en a reconnu que 3. Les compilations scientifiques récentes ont généralement suivi soit Cabrera, soit Huckinghaus :
* Cochon d'Inde - Cavia porcellus
* Cobaye de montagne - Cavia tschudii
* Cobaye de Patzelt - Cavia patzelti
* Cobaye de Santa Catarina - Cavia intermedia
* Cobaye du Brésil - Cavia aperea
* Cobaye luisant - Cavia fulgida
* Grand cobaye - Cavia magna
CLASSIFICATION
SOURCES
Système d'information taxonomique intégré (ITIS)
iNaturalist
* Josh Vandermeulen - iNaturalist CC-BY-NC-ND
* André Ambrozio - iNaturalist CC-BY-NC
* Ezequiel Vera - iNaturalist CC-BY-NC
* Eden Fontes - iNaturalist CC-BY-NC
* Gustavo Fernando Durán - iNaturalist CC-BY-NC-SA
* Flora de Santa Catarina - iNaturalist CC-BY-NC