Si les preuves génétiques indiquent clairement que les carnivores malgaches constituent un groupe monophylétique, c'est-à-dire descendant d'un ancêtre commun, la systématique interne est plus controversée. Les mangoustes de Madagascar forment probablement aussi un groupe monophylétique, bien que la position de la galidie unicolore et donc du genre Salanoia ne soit pas connue avec précision. Durbin et coll. 2010, sur la base de leur enquête, suggèrent une relation de groupe frère entre le genre Salanoia et Galidia et Galidictis.
Isidore Geoffroy Saint-Hilaire considèrait qu'une seule espèce appartenait au genre Salanoia, la galidie unicolore. Plus tard, au début du XXIe siècle, une nouvelle espèce a été découverte, toujours à Madagascar, mais plus petite que la galidie unicolore, qui a été nommée Salanoia ducerelli en hommage à Gerald Durrell.
Les deux espèces du genre Salanoia actuellement reconnues sont :