Selon la classification actuelle du World Register of Marine Species (WORMS), la famille des Phocoenidae compte six espèces réparties en quatre genres distincts.
Australophocaena est un genre appartenant à la famille des Phocoenidae. L'unique cétacé le représentant est le marsouin à lunettes (Australophocaena dioptrica)
Neophocaena est un genre appartenant à l'ordre des cétacés dans la famille de Phocoenidae. L'unique représentant est le marsouin aptère (Neophocaena phocaenides)
Phocoenoides est un genre appartenant à l'ordre des cétacés dans la famille des Phocoenidae. Son seul représentant est le marsouin de Dall (Phocoenoides dalli)